Characterization and distribution of viridans group streptococci isolated from infectious endophthalmitis and keratitis / Caracterização e distribuição de estreptococos do grupo viridans isolados de endoftalmite infecciosa e ceratite

ABSTRACT Purpose: The aims of this study were to characterize alpha-hemolytic streptococci among isolates from cases of infectious endophthalmitis and keratitis and to determine their distributions. Methods: The sample included 27 and 35 nonduplicated isolates of alpha-hemolytic streptococci recovered from patients with infectious endophthalmitis (2002-2013) and keratitis (2008-2013), respectively. Isolates were identified by the optochin susceptibility and bile solubility tests, using a biochemical identification system. The minimum inhibitory concentration was determined by the broth microdilution method. Molecular identification was performed by analyses of three constitutive genes and the complementary multilocus sequence. The molecular epidemiology of Streptococcus pneumoniae was investigated using multilocus sequence typing, and the presence of the capsular polysaccharide-encoding gene was assessed using conventional polymerase chain reaction. Outcomes were evaluated using the patients' medical records. Results: Phenotypic tests differentiated S. pneumoniae from other alpha-hemolytic streptococci, consistent with later molecular identifications. Streptococcus oralis was significantly prevalent among the endophthalmitis isolates, as was S. pneumoniae in the keratitis isolates. High levels of susceptibility to antibiotics were observed, including vancomycin, cephalosporins, and fluoroquinolones. High genetic variability was detected among the 19 S. pneumoniae strains, with 15 predicted to be encapsulated. The medical records of patients with infectious endophthalmitis were reviewed (n=15/27; 56%), and final visual acuity was assessed in 12 cases (44%). Many patients progressed to a final visual acuity state of "no light perception" (6/12; 50%), "light perception" (3/12; 25%), or "hand motion" (1/12; 8%). The medical records of patients with infectious keratitis were also reviewed (n=24/35; 69%), and final visual acuity was assessed in 18 cases (51%). Similarly, most patients progressed to a final visual acuity state of "no light perception" (6/18; 33%), "light perception" (1/18; 6%), or "hand motion" (6/18; 33%). Overall, the majority of patients progressed to a final visual acuity state of "no light perception" (12/30), "light perception" (4/30), or "hand motion" (7/30). Conclusions: The distribution of alpha-hemolytic streptococci in ocular infections suggested the presence of a species-specific tissue tropism. The prognoses of patients with ocular streptococcal infections were highly unfavorable, and antibiotic resistance did not contribute to the unfavorable clinical progressions and poor outcomes.

RESUMO Objetivo: O objetivo deste estudo foi caracterizar os estreptococos alfa-hemolíticos isolados de endoftalmite infecciosa e ceratite e determinar sua distribuição. Métodos: A amostra incluiu 27 e 35 isolados não-duplicados de estreptococos alfa-hemolíticos recuperados de pacientes com endoftalmite infecciosa (2002-2013) e ceratite (2008-2013), respectivamente. Os isolados foram identificados pelos testes de suscetibilidade à optoquina e bile solubilidade, utilizando um sistema de identificação bioquímica. A concentração inibitória mínima foi determinada pelo método de microdiluição em caldo. A identificação molecular foi realizada pela análise de três genes constitutivos e análise complementar de sequências multilocus. A epidemiologia molecular do Streptococcus pneumoniae foi investigada por tipagem de sequência multilocus, e a presença do gene codificador do polissacarídeo capsular foi avaliada por reação em cadeia da polymerase convencional. Os resultados foram avaliados utilizando os prontuários médicos dos pacientes. Resultados: Os testes fenotípicos diferenciaram S. pneumoniae dos outros estreptococos alpha-hemolíticos, consistentes com identificações moleculares posteriores. S. oralis foi significativamente prevalente entre os isolados de endoftalmite, assim como S. pneumoniae nos isolados de ceratite. Foram observados altos níveis de suscetibilidade a antibióticos, incluindo vancomicina, cefalosporinas e fluoroquinolonas. Alta variabilidade genética foi detectada entre as 19 cepas de S. pneumoniae, com 15 previstas para serem encapsuladas. Os prontuários médicos dos pacientes com endoftalmite infecciosa foram revisados (n=15/27; 56%), e a acuidade visual final foi avaliada em 12 casos (44%). Muitos pacientes evoluiram para um estado final de acuidade visual de "sem percepção luminosa" (6/12; 50%), "percepção luminosa" (3/12; 25%) ou "movimentos de mãos" (1/12; 8%). Também foram revisados os prontuários médicos dos pacientes com ceratite infecciosa (n=24/35; 69%), e a acuidade visual final foi avaliada em 18 casos (51%). Da mesma foram, a maioria dos pacientes evoluiu para um estado final de acuidade visual de "sem percepção luminosa" (6/18; 33%), "percepção luminosa" (1/18; 6%) ou "movimentos de mãos" (6/18; 33%). No geral, a maioria dos pacientes evoluiu para um estado final de acuidade visual de "sem percepção luminosa" (12/30), "percepção luminosa" (4/30) ou "movimentos de mãos" (7/30). Conclusões: A distribuição de estreptococos alfa-hemolíticos nas infecções oculares sugeriu a presença de um tropismo de tecido específico da espécie. Os prognósticos dos pacientes com infeções oculares por estreptococos foram altamente desfavoráveis e a resistência a antibióticos contribuiu não para as progressões clínicas des­favoráveis e os maus resultados.

Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus carrying SCCmec type IV in southern Brazil

INTRODUCTION: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is an important pathogen commonly associated with nosocomial infections. However, it has also been associated with community-acquired skin and soft tissue infections (CA-MRSA). There are few data on the identification and prevalence of CA-MRSA infections in Brazil. METHODS: This is a cross-sectional study of 104 patients with community-acquired skin infections attending two health care centers in Porto Alegre, southern Brazil. MRSA isolates were characterized by molecular methods, including detection of the mecA gene by PCR, gene SCCmec typing, Panton-Valentine leukocidin (PVL) detection, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), and multilocus sequence typing (MLST). RESULTS: From the 104 samples, 58 Staphylococcus aureus isolates were obtained, of which five (8.6%) had a CA-MRSA-resistant profile. All five isolates had the mecA gene and amplified to SCCmec type IV. Analysis of chromosomal DNA by PFGE revealed the presence of two clusters related to international clones (OSPC and USA 300), with a Dice similarity coefficient >80%. The study was complemented by MLST, which detected three different strains: ST30, ST8, and ST45, the latter not presenting any relation with the clones compared in PFGE. CONCLUSIONS: The presence of CA-MRSA reveals an important change in the epidemiology of this pathogen and adds new elements to the knowledge of the molecular biology of infections by MRSA with SCCmec type IV in southern Brazil.

Sepse por Staphylococus aureus resistente à meticilina adquirida na comunidade no sul do Brasil / Sepsis due to community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus in southern Brazil

Staphylococcus aureus resistente à meticilina foi inicialmente descrito como um típico microrganismo adquirido em infecções nosocomiais. No entanto, nos últimos anos Staphylococcus aureus resistente à meticilina adquirido na comunidade é causa de infecções de pele e tecidos moles, mas infecções graves como pneumonia e sepse podem ocorrer. Este relato descreve um caso de sepse em criança, complicado com pneumonia secundária a lesão em partes moles por Staphylococcus aureus resistente à meticilina adquirido na comunidade no Sul do Brasil. O paciente foi atendido em Unidade de Emergência com história de ferimento provocado por trauma em membro inferior que evoluiu para celulite, pneumonia e sepse.

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus was initially described as a typical microorganism acquired in nosocomial infections. However, over recent years, community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus has been a cause of skin and soft-tissue infections. Serious infections such as pneumonia and sepsis can also occur. This report describes a case of sepsis in a child that was complicated by pneumonia secondary to soft tissue lesions that were due to community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus in southern Brazil. The patient was attended at the Emergency Unit with a history of injury caused by lower-limb trauma that evolved to cellulitis, pneumonia and sepsis.

Isolamento e caracterizaçäo dos genes codificadores da glicoproteína de superfície de 90kDa(GP90) e das proteínas ricas em serina, alanina e prolina (SAP) de Trypanosoma cruzi / Isolation and caracterization of the genes that encode a surface glycoprotein of 90 kDa(GP90) and serine-, alanine-, and proline-rich proteins(SAP) of T. cruzi

Os tripomastigotas metacíclicos do Trypanosoma cruzi expressam na sua superfície uma proteína majoritária de 90 kDa (GP90). Anteriormente, nós tínhamos relatado o isolamento de um clone de cDNA (T7, GenBank L11287) que codifica a regiao carboxi-terminal da GP90. Com o objetivo de isolar cópias completas da regiao transcrita do gene GP90, nós clonamos cDNAs por RT-PCR e triagem imunológica de bibliotecas de expressao de cDNA. O clone cDNA-L1, o protótipo do gene GP90, apresenta uma fase de leitura aberta (ORF) que codifica um polipeptídeo de 694 aminoácidos com uma Mr aparente de 75.839,97 daltons. Ele paresenta dois motivos Asp (SxDxGxTW), assim como o motivo VTVxNVFLYDR, ambos comuns a todos membros da superfamília GP85/sialidase de T. cruzi. A ORF do cDNA-LI contém dois possíveis codons de iniciaçao e um sítio de "splice" antes do segundo ATG, sugerindo a existência de desplicing" alternativo nos transcritos do gene GP90. O cDNA J20b, isolado por triagem imunológica de uma biblioteca de expressao, codifica o domínio C-terminal da GP90 com uma seqüência típica de inserçao de âncora GPI. Análise dos clones de cDNA GP90 revelou a existência de vários sítios de modificaçoes pós-traducionais, tais como N-glicosilaçao e adiçao de âncora GPI. Estruturalmente, as GP90s sao glicoproteínas de superfície contendo cadeias de oligossacarídeos N-ligados e podem ser ancoradas à membrana por uma seqüência GPI. Comparaçao das seqüências do gene GP90 com membros do grupo II (GP85, TC85, SA85, ASP-2) da superfamília das GP85/sialidase revelou 52-62 por cento de identidade ao nível de aminoácidos, com regioes bastante conservadas separadas por seqüências divergentes de aminoácidos. Baseando-se nas suas propriedades estruturais os genes iiP90 poderiam ser considerados como membros do grupo II da superfamília das GP85/sialidases. Análise de "Northern blot" mostrou que os genes GP90 sao preferencialmente acumulados nos tripomastigotas metacíclicos. Estudos adicionais sobre a transcriçao destes genes utilizando-se RT-PCR mostrou a presença de transcritos GP90 em...(au)